Предоставляет оборудование для проведения исследований в области молекулярной биологии, микробиологии и молекулярной медицины методами атомно-силовой микроскопии и сканирующей туннельной микроскопии. На базе ЦКП «Бионаноскопия» создан научно-образовательный центр, в задачи которого входит подготовка специалистов высшей квалификации на современном оборудовании.
Основная задача ЦКП - повышение качества научных исследований.
ЦКП располагается на территории МГУ им. М.В. Ломоносова и позволяет научным группам, базирующимся в Москве, расширить спектр инструментов, регулярно используемых в работе.
В работе ЦКП «Бионаноскопия» принимают участие 4 академика РАН, 2 член-корреспондента РАН, а также профессора, преподаватели, научные сотрудники МГУ. Более 40% коллектива составляют молодые ученые.
Центр коллективного пользования «Бионаноскопия» основан в 2000 году. За время существования ЦКП организовал научно-практическую школу «Экспериментальная аналитическая нанотехнология», провел большое количество научных встреч и семинаров в области молекулярной биологии, микробиологии и молекулярной медицины. ЦКП «Бионаноскопия» является учредителем ежегодной международной конференции «Современные достижения бионаноскопии».